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    基于流式細胞技術的靈芝基因組大小估測


    【發(fā)布日期】:2019-01-18  【來源】:菌物學報
    【作者】李秋實 徐江 朱英杰 孫超 宋經元 陳士林
    【機構】中國醫(yī)學科學院北京協和醫(yī)學院藥用植物研究所瀕危藥材繁育國家工程實驗室
    【摘要】以藥典規(guī)定的靈芝正品來源靈芝Ganoderma lucidum作為研究對象,利用已完成全基因組測序的黑曲霉Aspergillus niger作為內標,通過機械破碎菌絲體的方法獲得合適濃度的細胞核懸液,碘化丙啶熒光染色后成功應用流式細胞術進行基因組大小估測。經過優(yōu)化材料培養(yǎng)、樣品制備、上機分析等實驗條件,估測得出靈芝基因組大小(48.98±0.60)Mb,為靈芝基因組學研究提供重要數據。該方法簡捷穩(wěn)定,在蕈菌范圍內,首次得到了全基因組測序數據與光學圖譜結果驗證,為蕈菌基因組學研究提供重要技術平臺。 
    【基金】國家自然科學基金重點項目(No.81130069); 國家科技支撐計劃(No.2012BAI29B01); 教育部長江學者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃(No.IRT1150);
    【關鍵詞】DNA含量; 熒光染色; 蕈菌;
     
     
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